Sajnos nem lehet ilyet. Pont az a lényege a flatpak-nek, hogy centralizált rendszer, és csak a saját csomagkezelőjével tudod töltögetni, telepíteni. Ha megnézed a flathub-on is, rákattintasz egy szoftverre, akkor az a forrásfájl, amit kapsz, egy csomagkezelős adathalmaz, amivel csak a flatpak tud mit kezdeni, még véletlenül sincs benne közvetlen URL. Van benne egy URL, de az a repójé, és nem a közvetlen csomagé.
Ez nem olyan, mint mondjuk a .deb, .rpm, vagy pacman-féle pkg.tar.zst, hogy közvetlen URL-ről kézzel is le tudod töltögetni, és különböző archiver-ökkel meg tudod nyitogatni, ki tudod bontogatni (ar, rpm2cpio, cpio, tar, stb.). Ha mégis hasonlóra van igényed, akkor nézz rá az adott szoftverre, hogy AppImage van-e belőle, azokat lehet kézzel töltögetni.