Szerintem locsemegének igaza van, amennyiben ebben a dologban nem nagyon lehet megúszni a munkát. Neked kell összeszedned, hogy mit akarsz elmenteni. (Elvégre amit elfelejtesz belerakni a mentésbe, az értelemszerűen nem lesz ott a helyreállításkor.) Valószínűleg ez is egy hosszabb folyamat lesz, és nem árt némi szemléletváltás sem. Pl. ha telepítesz egy számodra új programot, és hasznosnak találod, akkor érdemes ennek a beállításait is felvenni a mentendő dolgok közé. (A programhoz tartozó cosmagok pedig mehetnek a telepítendő csomagok listájára.) Ugyanígy érdemes lehet új (al)könyvtárfa létrehozásakor minél hamarabb eldönteni, hogy kell-e menteni a belekerülő dolgokat.
Írtad, hogy Ansible-t is használsz, az hasznos lehet. (Nekem is van félkész játszóskönyv-gyűjteményem telepítés utánra.) Saját beállítófájlok kezeléséhez tudom ajánlani a GNU Stow-t (a mentendő beállítófájljaim a ~/etc alatt laknak, de linkelve vannak az "eredeti" helyükre), mentéshez pedig a borgbackup is jó lehet. (Ceterum censeo rejtett könyvtárbejegyzéseket esse delendam.)
Egyébként itt is fontos és hasznos a mentés tesztelése. Ha mondjuk VM-be vagy félreeső gépre telepítesz új OS-t, és azon kipróbálod a visszaállítást, kiderül, mit hagytál ki, mi nem működik, mi működik nehézkesen. Ha eleget csinálod, lehet egy tökéletes elég jó mentésed. :)