Nincs vele sok gond, csak annyi, hogy a 7-es xorg a /usr/lib/xorg alatt tartja a libjeit, míg a 6.9-es az /usr/X11/lib-ben ha jól emlékszem (régen volt már a 6.9-es). És ahogy én tudom az új ATI és NVIDIA installerek is már megtalálják ezeket az új PATH-okat. Szóval igazából nem lehet vele gond.
Persze ha fordítod, akkor meg pláne nem elvégre akkor tudod mit hova pakoltatsz vele.