Nem balga kérdés, és de: LVM-en vannak az adatok (igazából majdnem minden LVM-en van).
De amúgy mit magyarázna ez?
Nincs rollback (MyISAM-nál ez eleve nem releváns), ahogy fentebb írtam, Workbench-ben csináltam, szerintem ott az alter table nem tranzakción belül van, és a create table sem. Ill gondolom ha valamilyen csoda folytán mégis így történt volna, akkor az új session-ben a tábla nem lett volna üres.
Nincs binlog :(.