A javascript az ECMA-262 script egy "dialektusa", böngészőkben találkozhatsz vele a leggyakrabban, de tud javascriptet futtatni a Photoshop vagy az Acrobat Reader is. Mint már előttem is leírták, ne ragaszkodj görcsösen ahhoz, hogy javascripttel akarsz időt szinkronizálni, mert valószínűleg nem fog menni. (Bár nagyon nyakatekert megoldásokat el tudok éppen képzelni...)
Ami Neked kellhet, az a következők egyike (például):
1. a telefonban futó J2ME java alkalmazás, de ezzel több gond is van, például nem biztos, hogy tudod vele állítani a rendszer óráját (erre szerintem elég jó esély van), drága certet kell venned hozzá, hogy engedje beszélgetni wapon keresztül, vagy mindig engedélyezned kell kézzel, és így már nem kevésbé macerás, mintha kézzel állítanád be. Értem, hogy szerinted ez technikailag visszalépés, de talán nem tragédia, ha a telefonod ki tudja, mennyire pontos órája pár másodpercet néha siet vagy késik.
2. egy PC-n futó szoftver, ekkor a telefonnak támogatnia kell, hogy a PC-s interface-én keresztül vélhetően valami saját protokollal beállíthasd az időt. Pont ezt ugyan nem próbáltam, de a SE telefonokat, ha jól emlékszem, egyszerű AT parancsokkal lehet vezérelni. Ehhez meg kell szerezned ennek a kommunikációnak a leírását, a dolog előnye, hogy gyakorlatilag bármilyen nyelven implementálhatod, ami tud beszélgetni a telefonnal (a javascript nem ilyen).
A feltett kérdésekből arra következtetek, hogy még nincs nagy tapasztalatod ebben a témában, a legegyszerűbb megoldásnak tehát azt találom, ha keresel erre egy kész megoldást, és nem magad akarod megírni.