Szerintem nem érted, amit írok. Az nem baj, ha a Windows ír az EFI partíción lévő filerendszerre, hiszen az azért van. Épp az lenne az EFI lényege, hogy attól még a másik oprendszer boot file-jai megmaradnak. A gond azzal van, hogy az EFI bejegyzéseket rombolja szét a Windows. Ezek a bejegyzések szerintem az alaplapon flash memóriában vannak tárolva, nem pedig háttértáron. Innentől kezdve lényegtelen, hogy lehúzod-e a telepítés idejére az SSD-t a SATA portról.
A másik, hogy nem minden alaplap tud legacy boot-ot, s ez egyre inkább így lesz.
Arról beszélek, ami az efibootmgr paranccsal piszkálható. Windowsra is megvan ehhez a parancs, csak nem emlékszem már a nevére.
tr '[:lower:]' '[:upper:]' <<<locsemege
LOCSEMEGE