Azt az apróságot ne felejtsd el, hogy a webes tartalmat olvasnia kell a webszervernek és esetleg írnia, ha PHP-s cuccok mennek. Az miért nem jó megoldás, hogy minden weboldal külön ftp, ha már mindenképp akarod? Az ügyfél pedig ha egyben kéri, akkor úgy kapja és kész.
Látni pedig mindent fognak, max nem tudnak belelépni és/vagy olvasni.
Nem tudom hány vhostot akarsz így, de nekem nagyon úgy tűnik hogy soknál már nem igazán lesz karbantartható.