Szia!
Hátha az alábbi két hivatkozásban szereplő leírás segít megfelelő SAN tanusítványokat generálni, a jelenlegiből hiányzó nevekkel:
https://blogs.technet.microsoft.com/exchange/2014/03/19/certificate-pla…
https://technet.microsoft.com/en-us/library/dd351044(v=exchg.150).aspx#…
A windowsos letsencrypt kliensnél (Let's Encrypt Simple Windows Client 1.9.1.38228) a --san kapcsoló után manuális módban fel lehet sorolni a használni kívánt neveket, de a manuálisan generáltat nem tudja megújítani, azt kézzel kell újra létrehozni, ha lejár.