Nem ebbe szaladtál bele?:
https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=781172
Februárban próbáltam utoljára, akkor még nem volt jó. Nem EFI specifikus a probléma, nekem simán sem ment.
Megkerülhető szerintem, ha a külön boot partíciót készítesz mindegyik diszkre azonos tartalommal RAID és LVM nélkül. Nem szép, tudom. :)