Először el kellene dönteni, hogy mit szeretnél csinálni. A Docker segítségével Linux-alapú konténereket kezelni, vagy Windowson szeretnél hasonló OS-virtualizációt.
Maga a OS-virtualizáció nem újkeletű dolog, kérdezz meg egy FreeBSD Jail felhasználót erről, vagy egy Solaris Containers adminisztrátort. Windowsra ugyanilyen régóta érhető el hasonló megoldás, pl. a Parallels Virtuozzo személyében, de régóta létezik a VMware ThinApp is és Windows 2016 TP3-tól a MS saját Containers megoldását is használhatod.
Az mindenesetre nem túl erős érv, hogy te darus csörlőt szeretnél a villás raklapemelő targoncára, és amiért nincs rá, ezért nem jó a targonca...
Ha mklink kapcsán az a bajod, hogy alapértelmezetten biztonsági okokból csak adminisztrátorok használhatják, akkor ezen könnyen lehet segíteni: http://superuser.com/questions/124679/how-do-i-create-a-link-in-windows…
Bár továbbra se látom, hogy ez a linkelés miért ennyire fontos...