i-MSCP felület alatt nginx megy, a vhostok alatt apache. Ez egy jó ötlet tőlük.
Debian 7->8 i-MSCP-nél megoldott. Panel update kell neki és az apache configot aktulizálja. Installer szintén a helyes configot tölti be, lévén változott pár szintaktika Apache 2.2->2.4 -nél.
IspCP-nél pedig magadnak kell megtenni ezt a talán 5-10 módosítást a template fájlok között és jól működik Debian 8 alatt is.
Nálad szerintem a memória lesz a szűk keresztmetszet. MySQL akkor szokott leállni.