Csináld úgy, ahogy sok más rendszer is csinálja: létrehozol egy /var/db/pkg könyvtárat, és ebbe pakolsz könyvtárakat, pl. firefox-32.0, ami arra utal, hogy a firefox 32.0 van telepítve. Minden ilyen könyvtárban lenne egy installed-files, meg ilyesmi fájlok. Nézd meg a Slackware-nél, ott is így csinálják (úgy rémlik).