Jogosultságok rendben vannak? Mert nem biztos, hogy ugyanazon felhasználó nevében fut CRON-ból indítva, mint amikor kézzel indítod. Ellenőrizd a kimeneti fájl teljes elérési útján a jogosultságokat (a teszt idejére mindenki írhassa és beléphessen a könyvtárakba). Illetve megpróbálhatsz egy sima fájl létrehozást tenni a PHP szkriptedbe és megnézni, mindkét indítás esetén létrejön-e a fájl.