Szerintem igen is van értelme ezeknek a funkcióknak. Előfordulhat, hogy a honlapot feltörik (nem miattad), ami attól a pillanattól kezdve káros lehet minden szempontból a szervezetre nézve.
Érdemes md5-tel tartalom ellenőrzést rendszeresíteni és bizony nem árt átfésülni a html (stb) tartalmakat káros kódok miatt. Láttam olyat, hogy figyelmetlenségből maga a webszerkesztő fertőzte meg a weboldalt. Ilyenkor hiába az md5! Kell "valami", ami legalább az ismert szekvenciákra figyelmeztet!