Ezért írtam, hogy elvileg. Meg ugye sok múlik azért a megvalósításon is. Kohana esetében a cascading filesystem miatt ugye az összes modul könyvtárát végig kell tekerni minden autoload-nál, ami feltételezem még egy fokkal lassabbá teszi a dolgot, de semmiképpen sem egy olyan tényező ami miatt megérné include-okra váltani.