Fedorán rootfs-nek a btrfs-t próbáld inkább, alapból nem támogatott FS-sel csak szívni fogsz, ha mindenáron zfs-t akarsz root FS-nek, akkor a Fedora nem a legjobb választás.
Ha single user, vagy rescue módban bootolsz be, akkor nem fogja a könyvtárakat a rendszer, át fogod tudni másolni, fstab-ot módosítani, stb.