Biztonsági okból (mert a felhasználók átlaga érzéketlen a biztonságra vagy szimplán csak buta tök) az alkalmazások teljesen szeparálva vannak. Annyira, hogy rootolás vagy adb nélkül egyik sem láthatja a többi adatait a belső tárolón (internal storage), csak az SD kártyán (external storage). A Heliumnak rootolás nélkül azért kell külső gép, mert ő is csak az adb fejlesztői interfészen keresztül kap ilyen erős jogot. Ezért kell az adb-vel oltárira vigyázni, nem szabad bekapcsolva felejteni. És a fenti védelem kikerülése miatt nagyon veszélyes a rootolás is.