"ha az adott config fájlból kiszedem a SkipFiles="REGEXP[akarmihulyesek]" sort"
"A REGEXP[] közé bármit bírhatok"
Mivel most már kétszer is leírtad, így biztos nem elütésről van szó. A dokumentáció szerint a SkipFiles is a REGEX szót használja, és nem REGEXP formában kell megadni. Biztos hogy jó az úgy?
# grep REGEXP /usr/lib/cgi-bin/awstats.pl
#
# grep REGEX /usr/lib/cgi-bin/awstats.pl | wc -l
14
#
Mindamellett elfelejtetted leírni az AwStats verzióját, a használt új és régi rendszer típusát, hogy logol-e valamit, mégis pontosan hogy néz ki az a regexp stb.