KDE-t használsz? mert ez esetben a gtk-s alkalmazásoknak külön kell át állítani a betűméretet, ha nem csal az emlékezetem.
Konzolból indítsd a következőt:
gnome-font-properties
Asszem itt tudod beállítani, erre hallgat a Firefox is. Lehet fel kell telepíteni hozzá vmi package-et (gnome-control-center?), h menjen.