Az AMD nincs miért gondot okozzon. Processzor szinten teljesen támogatott, olyannyira, hogy a 64bites x86 pocesszort az AMD teremtette nem az intel.
Az alaplap az már más téma. Desktop alaplapokkal, úgy intel mint amd téren nekem voltak stabilitási problémáim linux szerver estében.
Az ECC kapcsán, a proci, a proci memóriavezérlője és a memória lehet ECC, de pl én megjártam 8 éve 3 típusú desktop AM4 alaplappal, hogy ezt (ecc) mivel nem lehetett bekapcsolni bios-ban, nem ment az ECC. Tehát az alaplapgyártó BIOS-a bekavarhat.
A fenti okok miatt hacsak tudsz, próbálj igazi szerver alaplapot beszerezni.
Hirtelen ezt találtam: https://www.supermicro.com/en/products/motherboard/h13sae-mf, kb 170000 FT
https://www.supermicro.com/en/products/motherboard/caram5-m
ehhez nem találtam árat.
Még egy tip, az AMD-nek létezik PRO szériája és léteznek ehhez a PRO szériához alaplapok. Ezek már minősített termékek és többnyire linuxra is optimizálják őket. Ezeknek nézhetsz utána. Én 7 éve nem tudtam ilyet beszerezni, de azóta lehet szállíthatókká váltak.