Őőő tegyél fel egy fedora-t és arra egy wine-t. Ugyanis nálam így működik... :) Rendszer indulásakor kiírja, hogy windowsos binárisok regisztrálása wine-hez (vagy vmi hasonló) és onnantól mennek.
Szóval van egy /etc/rc.d/init.d/wine script és az intézi az egészet. Ha érdekel, elküldöm... :)