Nem így tudom.
Az rsync alapból nem bántja a már a targeten lévő dolgokat, pont ezért van külön --delete kapcsolója...amit még "finomíthatsz" is:
--delete-before
--delete-during
stb....
..és nem a delete kapcsolóval ment az rsync természetesen.
Új kiterjesztést kapott a forrás file azaz az már más fájl...ezért nem értem.