PHP is jó, ha van. Ilyesmi elvileg:
select `group`,`value` from `valamitábla` group by `group`,`value`;
Erre fogsz kapni egy listát, hogy milyen group-value párok vannak, azokon végig tudsz iterálni:
select `prefix` from `valamitábla` where `group`= ... and `value` = ...;
Aztán ha itt több sort kapsz vissza, akkor a logikád alapján már tudod törölni a felesleget.