Szerintem nem a Windows, hanem az openssh rondított bele.
A kb. október vége óta a Windowsos git kliensben lévő legújabb openssh nem szereti már a régebben generált RSA kulcsokat, hogy pontosan milyet és miért, azt 1 perc alatt nem sikerült megértenem, úgyhogy hagytam a francba és generáltam ed25519 formátumú új kulcsot.