Az IBM DOS meg az MS-DOS ugyanaz a szoftver volt kb. a 7-es verzióig, csak egy-két felirat meg fájlnév volt benne kicserélve. Mire meg különvált, addigra a win.com-ból kiszedték ezt az ellenőrzést (kiadtak új binárist, amiben már nem volt benne), akkor már DR DOS-on is ment, de előtte nem futott. Pont ez volt a lényeg, hogy csak MS/IBM érdekeltségű, „eredeti” DOS-on menjen, és a konkurenciát és azok felhasználóit ellehetetlenítsék. FreeDOS-on is sokáig problémás volt, igaz az más okból.