Kezdjük ott, hogy ha idézőjelezed a teljes utasítást az hibára fut, vagyis biztosan nem így hívod a java-t.
PS C:\Users\BaT\dev\tools\jd-gui> java -jar .\jd-gui-1.6.6.jar
PS C:\Users\BaT\dev\tools\jd-gui> & "java -jar .\jd-gui-1.6.6.jar"
&: The term 'java -jar .\jd-gui-1.6.6.jar' is not recognized as the name of a cmdlet, function, script file, or operable program.
Check the spelling of the name, or if a path was included, verify that the path is correct and try again.
PS C:\Users\BaT\dev\tools\jd-gui> & java -jar .\jd-gui-1.6.6.jar
PS C:\Users\BaT\dev\tools\jd-gui>