Igen ez egy érdekes dolog. Én például Nginx-et használok már évek óta mindenütt, erre egy PHP csomag, ami kellett az Nginx-hez lehúzott és elindított egy egész Apache-ot, mert dependency-ként volt jelölve. Ubuntu vagy Debian, már nem emlékszem. Valahogy finomítani kellene ezeken a dolgokon, valami make menuconfig jellegű felület kellene vagy nem tudom.. :)
Ugyanígy elég gáz, hogy egy csomag újabb verziója megpusztul, mert config fájlban valami már nem jó neki. Tiszta szerencse, ha esetleg már csak akár 1 verzióval korábban warning-olt deprecation-re, de ez a ritkább eset.