Rég nem telepítettem már ubuntu-t, de ha manapság is ki lehet választani a telepítés végén hogy boot record telepítést automatán csinálja-e, szerintem ott válaszd ki manuálisan hogy melyik lemezre telepítse, talán megoldja a gondodat. Nem tudom milyen linuxxal, de én már jártam úgy hogy boot record telepítést hibásan csinálta meg a telepítő, és emiatt engem is no boot record fogadott az egyébként hibátlan telepítés után (lehet hogy pont ugyanezzel az alaplappal jártam így).
Nálam kodi-val üzemelt ez az alaplap 4-5 éve, ami ugye ubuntu alapú, szóval biztos hogy nem csak windows-al megy, a low level format pedig felesleges, elég egy "dd if=/dev/zero of=/dev/sdX bs=512 count=1" ahhoz hogy lenullázd a lemez boot rekordját, meg a particiós tábla elejét amitől az invalid lesz, így kapsz egy üresnek tűnő szüz lemezt.