Nem tudom, milyen Linuxot használsz. Debian10 alatt kivették a beépített debug bővítményt. A pluszban telepíthető projekttel kapcsolatos bővítmények egyike sem nyerte el tetszésem. Ami alapból van, az a legjobb; a Projekt menüből elérhető. Ez generál egy projekt fájlt. A hátránya, hogy abszolút útvonalak tárolódnak benne. A Projekt menüből tudod használni. Ha megnyitod a projekt fájlt, akkor megnyílik a hozzátartozó könyvtár. Az oldalsávon viszont szükség van egy jó könyvtár böngészőre; erre a célra a TreeBrowser bővítményt találtam a legjobbnak.
Ha debug, git vagy egyéb dologra van szükség, azt a beépített terminálban szoktam megoldani (Üzenet ablak). De legszívesebben nyitok egy külön terminálablakot; GUI fájlkezelőből, két kattintás.
(A Geany scriptelhető Lua nyelven; a kódon futtathatók parancssoros programok, a scriptekhez saját billentyűkombináció rendelhetők. De a leggyorsabb kódszerkesztő a Scite. Linuxon, Windowson egy villanás alatt pattan be az ablaka. Az is Lua nyelven scriptelhető.