Nyilván érdemes a CLI-t minél jobban ismerni (főleg az alapokat), de szerintem messze nem ennyire fekete-fehér a dolog. A verziókezelés pont az a témakör, ahol egy-egy jó GUI-s reprezentáció jelentősen meg tudja gyorsítani a munkavégzést.
Én pl. jellemzően Mercurialt használok, általában parancssorból. De eszembe nem jutna a branchek közötti kapcsolatokat, history-t vagy éppen commit előtt a módosított fájlokat (pláne a diffeket vagy rosszabb esetben merge conflictokat) CLI-ben turkálni, ha nem muszáj. Sokkal kényelmesebb (és számomra gyorsabb) egyes részfeladatokra a GUI használata a fa-nézetekkel, side-by-side diffekkel és hasonlókkal. Egyszerűen jobban átlátom, hogy mit csinálok. Minden másra meg ott a CLI. Ja, és olyan nagyon azért nem zavartam össze magam ezzel a megközelítéssel. :)