GoodSync nevű programot (fizetős, 10e körüli a license amennyire tudom) ajánlanám, sokáig használtam, nem volt olyan igényem amit ne tudott volna, és nem futottam hibába vele soha. Ami pl. jól jöhet neked is: tud naplózást és változások követését, naplózását teljes fájl szinten, pl. 100 kb-nál kisebb fájlok törlése-módositása esetén a másik oldalt is természetesen ezt megteszi, de előtte csinál belőle egy timestamp-es backup-ot. Elkerülhető az, hogy egyik gépen módositok, de hibásan, és a hiba átkerül a másikra, akkor nincs meg a hiba előtti példány.