100% biztonsággal nem lehet, de a nagyobb titkosszolgálatoknak külön csapatuk van erre, amelyek kifejezetten stegano témával foglalkoznak és ismerik az összes interneten fellelhető publikus (és sok nem publikus) stegano szoftvert és azok kódját, így ki tudják mutatni, ha azokat használva rejtettél valamit a képekbe. Ha teljesen saját - okos - módszerrel teszed, akkor jó eséllyel nem ismerik fel, de nagyon nehéz ezt elég okosan végezni. Egyrészt vannak mindenféle redundáns adatok a képformátumokban, amelyek ha nem egyeznek a steganozás miatt, akkor máris sejthetővé válik, hogy manipulált a képfile. Másrészt erős a gyanúm, hogy az ilyen csapatok behatóan ismerik azokat a jpeg libraryket és digitális fényképezőgép firmwareket, amelyek a képfile létrehozásában vesznek részt és ismernek olyan összefüggéseket, amelyeket mások nem. Így ha kapásból nem is tudják, hogy mi van elrejtve a képekben, az már elég indikátor számukra, ha valami nem stimmel a képfájlokkal kapcsolatban. Tudnak mindenféle entrópia és spektrum mérést végezni különböző szempontok szerint, amelyek szintén kimutathatják, ha rejtett információk vannak elkódolva a képekben és nem csodálkoznék azon sem, ha azt a néhány firmware/kamera gyártót esetleg rábírták volna már arra, hogy rejtett információkat kódoljanak bele a képekbe, ahogy a nyomtatógyártók esetén is megtörtént ez sok évvel ezelőtt.
Harmadrészt egy egyedi stegano szoftvert titokban tartani elég nehéz, főleg ha többedmagaddal akarod használni (pl. terrorista csoport), így előbb-utóbb a szolgálatok kezébe kerül és máris kiismerik a használt módszert...