A HDD nem gyűjtött be pár bad sectort?
imho a filerendszer típusa is nagyon sokat számít: stresszteszteltem egy P3-as gépen párat és az XFS tűnt a legjobb megoldásnak, pl a RiserFS-el ugyanaz a felállás jóval több RAM-ot evett, az EXT3 még ezen felül lassú is volt.
Tudom, hogy most a Linux guruk fogják a hasukat a röhögéstől mekkora hülyeséget beszélek, de többször is rápróbáltam a dologra és ezt tapasztaltam.