RTM:
dpkg --get-selections
és ott a lista, amit a dpkg --set-selection kapcsolóval eszik meg.
A konzol kimenetét úgy színezed, ahogy szeretnéd, pont az adja a szabadságodat, hogy nincs alapban semmi csiricsárézás beállítva :-P
Ha egy csomagból x verziót szeretnél használni, akkor visszatartható a frissítése, bár ez nem igazán javasolt szerintem. Mivel bináris repóból megy fel a cucc, így a függőségek "bedrótozottan" vannak jelen, viszont semmi sem akadályoz meg abban, hogy bármiből az src csomagot használd, és saját bináris csomagot készíts/telepíts fel.
A konfig fájlok frissítése akkor automatikus, ha nem lett matatva. Ha igen, akkor diff-et nézhetsz, meghagyhatod a régit, felrakhatod a csomagban lévő újat, stb.
Logok: /var/log/apt